Институттың миссиясы – ғылым саласында жоғары сапалы зерттеулер жүргізу және жоғары деңгейдегі зерттеу жобалары үшін қаржыландыруды ұсыну, қолданбалы және зерттеу құрылымдарын құру және дамыту.
Ғылыми-зерттеу институтының негізгі міндеттері:
Университет ғалымдарын ластанған суларды тұщыландыру және тазарту мәселелері бойынша жетекші ғалымдармен біріктіру үшін П.П.Ширшов атындағы Океанология институтымен (Мәскеу), «Келдыш орталығы» Мемлекеттік ғылыми орталығымен (Мәскеу) ынтымақтастық туралы меморандумдарға қол қойылды. Екі жыл бойы Ақтау маңындағы Каспий теңізін зерттеу үшін Океанология институтымен бірлескен экспедиция жүргізілді..